Na Placu Bohaterów Getta 18, róg ul. Targowej, w piętrowej kamienicy z 1886 r., mgr farmacji Józef Pankiewicz z Sambora założył w 1909 r. rodzinną aptekę. Od 1930 r. profesję farmaceuty kontynuował jego syn Tadeusz, który po ukończeniu studiów na UJ zaczął w niej pracować. Od stojącej na wprost wejścia figury orła na zegarze, aptekę nazwano „Pod Orłem”.
W czasie okupacji apteka znalazła się w obrębie Krakowskiego Getta. Pozostawiono ją w obawie przed wybuchem epidemii. Jako jedyna na całe Getto, była otwarta w dzień oraz w nocy. Szybko też stała się konspiracyjnym miejscem udzielania Żydom pomocy.
Obecnie Apteka Pod Orłem jest Oddziałem Muzeum Historycznego Miasta Krakowa.